Protein–RNA interactions for Protein: Q8N945

PRELID2, PRELI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID2Q8N945 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRELID2Q8N945 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms