Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL3Q8N8U3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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