Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RNF148Q8N7C7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RNF148Q8N7C7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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