Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms