Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms