Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMB2

TTLL5, Tubulin polyglutamylase TTLL5, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL5Q6EMB2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL5Q6EMB2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL5Q6EMB2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms