Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWF7

FBXO48, F-box only protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO48Q5FWF7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO48Q5FWF7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms