Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms