Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms