Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5B1Q2VPB7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms