Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSPP1Q1MSJ5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms