Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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COL24A1Q17RW2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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COL24A1Q17RW2 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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COL24A1Q17RW2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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COL24A1Q17RW2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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COL24A1Q17RW2 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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COL24A1Q17RW2 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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COL24A1Q17RW2 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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