Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LTC4SQ16873 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms