Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SNAPC1Q16533 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNAPC1Q16533 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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