Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS72Q15906 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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VPS72Q15906 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VPS72Q15906 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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