Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms