Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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