Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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