Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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UBE3CQ15386 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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UBE3CQ15386 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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UBE3CQ15386 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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UBE3CQ15386 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
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