Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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BRD3Q15059 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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BRD3Q15059 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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BRD3Q15059 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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