Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBFBQ13951 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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