Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNA1SQ13698 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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