Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SRSF6Q13247 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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