Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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