Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM32Q13049 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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