Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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