Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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