Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBRQ0VD83 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms