Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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