Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms