Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LTBQ06643 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LTBQ06643 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms