Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms