Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms