Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARID5AQ03989 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARID5AQ03989 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms