Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6Q03468 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms