Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms