Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms