Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms