Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX1P83916 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX1P83916 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX1P83916 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX1P83916 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX1P83916 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX1P83916 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX1P83916 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX1P83916 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX1P83916 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX1P83916 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms