Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIM1P81133 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms