Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP107P57740 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms