Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms