Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms