Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSG1P42857 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSG1P42857 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NSG1P42857 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms