Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms