Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms