Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL1P40616 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL1P40616 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms