Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OTX2P32243 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OTX2P32243 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OTX2P32243 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OTX2P32243 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OTX2P32243 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OTX2P32243 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OTX2P32243 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OTX2P32243 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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OTX2P32243 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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OTX2P32243 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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OTX2P32243 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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OTX2P32243 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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OTX2P32243 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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OTX2P32243 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OTX2P32243 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
OTX2P32243 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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OTX2P32243 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OTX2P32243 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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