Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFNP31947 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFNP31947 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFNP31947 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms