Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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CASQ1P31415 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASQ1P31415 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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